【TCMKB】使用Neo4j构建中医哮喘知识图谱的开端探索

admin 4天前 健康 203 2

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目    录

1.  中医临床知识图谱

2.  数据加工和准备

3.  将数据导入Neo4j数据库

4.  基本查询案例

5.  面向方药推荐的路径查询案例

6.  小结

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1.中医临床知识图谱

知识图谱手艺可以辅助我们确立疾病、证候、症状、治法、方子、药物等焦点观点之间的关系,把种种中医临床知识资源关联起来,实现资源的整合。Neo4j图数据库(Graph Database)是基于图论实现的一种新型NoSQL数据库,Neo4j在中医药知识图谱手艺系统中可作为图数据的存储堆栈,支持种种图算法和应用。

在信息所数据资源(特别是10余万临床医案)的基础上,可以构建“病、证、症、方、药”等焦点观点所组成的知识图谱,将事实型知识转换为观点性知识,更好地支持临床研究并辅助临床决议。例如,基于临床知识图谱,可确立临床表现(症状、证候、疾病)与方子、中成药之间的关系,据此向用户推荐药物疗法(推荐算法);也可检索与用户当前病历相关的医案、指南和知识库内容,辅助用户举行决议。

为实现上述想法,我们选择“中医治疗支气管哮喘”作为专题,在前期工作“中医哮喘专题知识库”的基础上,将中医临床数据集导入Neo4j图数据库中,并通过一些查询举行了测试。下一步拟实现图搜索、中成药推荐等功能。在本文中报告了开端的实验效果。


2.数据加工和准备

在前期工作中,已采集文献中关于名医、诊疗、病理、药物等方面的数据,从而确立了中医治疗支气管哮喘专题的结构性数据库。该数据库对中医哮喘诊疗手艺的相关数据举行了周全采集和存储,内容包罗:古今外文献、诊疗规范、方子、中药、临床研究、名医履历、医案、实验、养生保健、诊疗手艺、不良反应、西药、实验室检查等内容,数据量到达八万余条。

如图 1 所示,我们从数据库中提取出病、证、症、方、药等实体的信息,以及病证关系、方证关系、治疗关系、药证关系、方子组成关系、药症关系等实体间关系,组成中医临床知识图谱。接下来,拟基于知识图谱实现的第一个应用是中成药推荐。其基本思想是,凭据知识图谱之中疾病、证候、症状、病因及方药功效之间关系,征采临床表现与中成药之间的路径,这些路径就代表了临床表现与中成药之间的潜在关系,或者说在某个场景下可以适用或不适用的中成药(可推广到方、药等其他疗法)。详细的路径可以包罗:

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网友评论

  • (*)

最新评论

  • USDT充值 2020-12-22 00:03:32 回复

    从出道第一天起,他就明了,自己不是“偶像派”,也正由于如此,他卸掉了许多负担:很棒啊这个

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